瑞典人平均身高,rdrp

sddy008 观点 2022-07-20 130 7

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一个病毒有一个由单链负链RNA组成的基因组病毒RNA的产生

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所有负义ssRNA病毒都在其病毒粒体中包裹着RdRp.当病毒进入细胞脱壳后,RdRp以负单链RNA基因组为模板转录产生正单链RNA,正单链RNA既可以作为mRNA用于病毒编码蛋白的翻译,又作为复制中间体,复制合成子代负链RNA。

诺如病毒的病毒结构

诺如病毒遗传高度变异,在同一时期和同一社区内可能存在遗传特性不同的毒株流行。诺如病毒抗体没有显著的保护作用,尤其是没有长期免疫保护作用,极易造成反复感染。

诺如病毒有许多共同特征:直径约为26~35nm,无包膜,表面粗糙,球形,呈二十面体对称;从急性胃肠炎病人的粪便中分离,不能在细胞或组织中培养,也没有合适的动物模型;基因组为单股正链RNA;在氯化铯密度梯度中的浮力密度为1.36~1.41g/cm3;电镜下缺乏显著的形态学特征,负染色电镜照片显示,NV是具有典型的羽状外缘,表面有凹痕的小圆状结构病毒。

诺如病毒基因组全长约7.7kb,包含3个开放阅读框(Open readding frames,ORFs)。ORF1编码非结构蛋白,包括RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp);ORF2和ORF3分别编码主要(VP1)和次要(VP2)衣壳蛋白。VP1蛋白结构上可分为S和P区两个相邻的区域,其中S区形成内壳,构成VP1的底座;P区形成拱样结构突出于内壳外。P区可进一步分为P1和P2两个亚区,后者位于VP1的最外层,高度变异,目前认为是免疫识别和受体结合的关键部位。ORF1/ORF2的重组及P2区的变异大大丰富了NV的遗传多样性。根据VP1序列的同源性,诺如病毒可分为GI~GV五个基因群(Genogroup),其中引起人类感染的主要是GI和GII群,基因群可进一步分为不同的基因型(Genotype)。自1995~1996年诺如病毒首次导致世界性大流行以来,GII群中的第4基因型GII.4,一直在世界范围内的流行中占据主导地位,且几乎每隔两、三年,GII.4便会引发一次大范围流行,同时出现一种新的变异株。

催化转录的RNA聚合酶与RdRP作用时的区别是

作用底物不同。

RNA聚合酶底物是NTP;DNA聚合酶底物是dNTP。

RNA聚合酶作用不需要引物,而DNA聚合酶作用需要引物。RNA聚合酶本身具有一定的解旋功能,而DNA聚合酶没有,当需要解开双链的时候要解旋酶和拓扑异构酶的帮助。

RNA聚合酶只具有5‘到3’端的聚合酶活性,而DNA聚合酶不仅有5‘到3’端的聚合酶活性,还具有3‘到5’端的外切酶活性。保证DNA复制时候校对,所以复制的忠实性高于转录的。RNA聚合酶通常作用于转录过程;DNA聚合酶通常作用于DNA复制过程。

什么是逆转录病毒?与RNA病毒有何异同之处?

区别在于逆转录病毒只有一种产生蛋白质的方法,即逆转录,而RNA病毒有正译,负译,逆转录多种产生蛋白质的方法。逆转录病毒是RNA病毒的一种,两种病毒是包含关系。

RNA病毒是生物病毒的一种,属于一级。 它们的遗传物质是由核糖核酸组成(RNA ribonucleic acid),通常核酸是单链的(ssRNA single-stranded RNA),也有双链的(dsRNA double-stranded RNA).单链的RNA病毒根据他们的翻译意义可分为正译、负译和双向翻译的RNA病毒,正译的RNA病毒与mRNA相似,可以直接被宿主细胞翻译成蛋白质;负译RNA病毒则需要借助RNA酶的作用,以自身为模板编译出与原病毒相反义的RNA,之后再以此RNA来翻译成蛋白质。RNA病毒(RNA virus) 也称RNA型病毒。植物病毒,除少数例外(如花椰菜花叶病毒Caulif- lower mosaic virus),几乎都是RNA病毒。RNA病毒冠状病毒直径为80~160nm,为有包膜的单股RNA,病毒RNA的复制过程中,其错误修复机制的酶的活性很低很低,几乎是没有的,所以其变异很快。而疫苗是要根据病毒的固定基因或蛋白进行开发制作的,所以RNA病毒 疫苗较难开发。繁殖:是专性活细胞内寄生物。它不可单独进行繁殖,必须在活细胞内才可进行。RNA病毒有:艾滋病病毒,烟草花叶病毒,SARS 病毒,MERS病毒,埃博拉病毒(EBV),西班牙流感病毒,甲型H1N1流感病毒,禽流感病毒,噬菌体(有一部分噬菌体是DNA病毒,如T2噬菌体)等。

逆转录病毒(Retrovirus),又称反转录病毒,是RNA病毒的一种,它们的遗传信息不是存录在脱氧核糖核酸(DNA),而是存录在核糖核酸(RNA)上,此类病毒多具有逆转录酶。

反转录病毒的DNA基因组整合在宿主染色体上的位点是随机的。每个受感染的细胞一般有1~10份前病毒拷贝。反转录病毒DNA的整合是复制病毒RNA的必经阶段。反转录病毒的DNA插入宿主细胞染色体时,在5’LTR的U3左端和3’端LTR的U5右端各丢失2 bp,而在宿主染色体插入位点上生成4~6 bp的重复序列。只有当受感染细胞处于细胞分裂期间,反转录病毒DNA基因组才能接触到宿主细胞的遗传物质。因此,反转录病毒只能在分裂中的细胞内复制。

什么是结构蛋白 什么是非结构蛋白

应该说,病毒的结构和非结构蛋白是病毒学领域的基本概念,即使不能深入了解,也至少应略知一二,何况该同学硕士期间花费了三年时间专职从事了病毒学的科研工作。今天就简单谈谈这两个概念吧。

首先谈谈结构蛋白。结构蛋白是构成病毒结构的必需蛋白,可以是一种,例如圆环病毒和细小病毒。但更常见的是多种结构蛋白,如副粘病毒、布尼亚病毒等等。举个生动的例子吧,之所以称之为结构蛋白,因为少了其中任何一种,都不是一个完整的病毒颗粒,这就类似于人体,一定不能缺少心、肝、脑、肺等重要器官。若通过反向遗传技术,试图敲除某结构蛋白从而拯救重组病毒,通常也是徒劳的。

以麻疹病毒为例,该病毒有六种结构蛋白(N、P、M、F、H、L),各司其职,一个都不能少。N蛋白负责包装基因组以形成核衣壳;P蛋白作为辅助蛋白帮助RdRp行使mRNA转录和基因组复制功能;M蛋白为病毒颗粒的骨架蛋白,负责支撑病毒的外层;F蛋白为融合蛋白,负责病毒膜与细胞膜的融合;H蛋白为病毒的配体,负责与细胞受体结合;L蛋白为RdRp,负责mRNA转录和基因组复制。再举一个圆环病毒的例子,圆环病毒应该是目前已知最简单的病毒了,只含有一种结构蛋白(Cap蛋白),病毒外壳是由60个Cap蛋白构成的正二十面体对称状衣壳。

再谈谈非结构蛋白。非结构蛋白,顾名思义,虽可被病毒翻译,但通常不被包装进入完整的病毒颗粒。然而,也有少数非结构蛋白可以包装进病毒颗粒,例如流感病毒等。病毒之所以要在细胞内表达非结构蛋白,是因为其虽然不属于病毒结构组成部分,但对于病毒的复制、调控、免疫等一系列作用至关重要。有时候非结构蛋白比结构蛋白还多,例如口蹄疫病毒。某些非结构蛋白对于病毒的生理特性而言是非必需的,如果敲除掉,不会明显影响病毒的生长特性,这就类似于生理有缺陷的人,例如少了一个手指,但不影响日常生活。有些非结构蛋白可能与病毒的毒力相关,例如是干扰素的拮抗剂。通过反向遗传,把此类非结构蛋白基因敲除,如果依然能拯救出重组病毒,且病毒生长动力学未受明显影响,若再能证明重组病毒的毒力大大降低,那么这个非结构蛋白缺陷病毒株就可以作为候选疫苗株使用。

通常而言,结构越简单的病毒,其非结构蛋白对于病毒行使其生理功能而言,就越是不可缺少的。反之,结构越复杂的病毒(例如痘病毒、杆状病毒、腺病毒等),我们通常就可以按照具体意图敲掉一些非结构蛋白。

以上简单讨论了一点病毒结构蛋白和非结构蛋白的知识,该领域的研究一直是分子病毒学研究的热点,永不过时,非常重要,即使不能深入了解,

轮状病毒的病毒学

轮状病毒总共有七种,分别以英文字母编号为A、B、C、D、E、F与G等。人类主要是受到轮状病毒A种、B种与C种的感染,而其中最常见的是轮状病毒A种的感染。而这七种轮状病毒都会在其他动物身上造成疾病。

在轮状病毒A种之中有不同的病毒株,称之为血清变异株(serovar)。与流行性感冒病毒类似,轮状病毒使用了双重的分类系统,这样分类法是依据这个病毒体表面的两个结构性蛋白质来作分类的。糖蛋白VP7定义了G型而对于蛋白酶敏感的蛋白质VP4则定义了P型(这些蛋白质的细节请见下文)。P型会以一个数字来标示出P血清型,并用方括号内部的一个数字来标示所对应的P基因型。G血清型的表示方法很类似,但是G基因型的数字会与G血清型的数字相同。举个例来说,“轮状病毒Wa病毒株”(rotavirus strain Wa)就会被标示成“P1A[8]G1”。因为这两个决定G型跟P型的基因可以被分开传送而产生后代,所以两基因不同的组合就会产生各种不同的病毒株。 有六个病毒蛋白质(viral protein,VP)架构了整个病毒颗粒(病毒体)。这些“结构性”的蛋白质分别被称为VP1、VP2、VP3、VP4、VP6与VP7。除了这些结构性蛋白质之外,还有六个非结构性蛋白质(nonstructural protein,NSP),这六个蛋白质仅仅在轮状病毒感染的细胞中制造,而没有构成病毒体的结构。这六个非结构性蛋白质分别称为NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5与NSP6。

由轮状病毒基因组所编码的12个蛋白质中,至少6个会与核糖核酸结合。这些蛋白质在轮状病毒复制时所扮演的角色目前还没有完全被了解;它们的功用被认为有可能是与病毒体内核糖核酸的合成与包装相关,或是与将信使核糖核酸输送至基因体复制现场相关,或是与信使核糖核酸转译与基因表现调节相关。

结构性蛋白

VP1蛋白质位于病毒体核心,是一种核糖核酸聚合酶。在被感染的细胞中,这种酶会产生病毒蛋白质合成所需的信使核糖核酸转录复本,以及产生轮状病毒基因体核糖核酸片段拷贝来提供新产生的病毒体使用。

VP2蛋白质形成病毒体的核心层,并且结合核糖核酸基因体。

VP3蛋白质是病毒体内核的一部分,而且是一种称为鸟苷酸转移酶(guanylyl transferase)的酶。这种酶是一种加帽酶(Capping enzyme),也就是制作信使核糖核酸转录后修饰时候所用的5'端帽的酶。这个5'端帽保护病毒的信使核糖核酸免受核酸酶(以核酸为底物的水解酶)水解,使之能够保持稳定。

VP4蛋白质位于病毒体的表面,突出来而成为一个刺突(spike)。它连接细胞表面的受体分子,并且驱使病毒进入那个细胞。在病毒有传染性之前,VP4蛋白质会被一种可以在内脏发现的蛋白酶改变成VP5*蛋白质与VP8*蛋白质。VP4蛋白质决定了该病毒的毒性(Virulence),而它也决定了该病毒的P型。

VP6蛋白质形成壳体的体积。它是抗原性强的蛋白质,并且可以被用来分辨轮状病毒的种类。这个蛋白质被实验室用来进行轮状病毒A种感染症的各种测试上。

VP7蛋白质是一种建立病毒体外层表面的糖蛋白。扣除掉它在病毒结构上的功用之外,它也决定该病毒珠的G型。VP7蛋白质跟VP4蛋白质一样,都被免疫力(immunity)当作是防止感染的途径。

病毒的非结构性蛋白

NSP1蛋白质是第5号基因的产物,是一种非结构性蛋白质,而且也是核糖核酸结合蛋白质(RNA-binding protein)。

NSP2蛋白质是一种核糖核酸结合蛋白质,此种蛋白质会堆积于细胞质内含物(即病毒质,viroplasm)之中,并且是一种基因体复制时所需的蛋白质。

NSP3蛋白质受到感染细胞中的病毒信使核糖核酸影响,它负责停止细胞蛋白质合成的工作。

NSP4蛋白质是一种病毒性肠毒素(enterotoxin),会引起腹泻的症状。此蛋白质是首种发现的病毒性肠毒素。

NSP5蛋白质是由轮状病毒A种基因体第11号基因编码的产物。而在受病毒感染的细胞中,NSP5蛋白质堆积在病毒质中。

NSP6蛋白质是一个结合核酸的蛋白质,是由第11号基因于开放阅读框架阶段的编码产物。 轮状病毒的基因与蛋白质核糖核酸片段(基因) 尺寸(碱基对数) 蛋白质 分子量(kDa) 所在位置 功用 1 3302 VP1 125 位于核心的顶点 核糖核酸依赖性的核糖核酸聚合酶(RdRp) 2 2690 VP2 102 形成核心的内壳 刺激病毒的核糖核酸复制酶 3 2591 VP3 88 位于核心的顶点 鸟苷酸转移酶,信使核糖核酸加帽酶 4 2362 VP4 87 表面刺突 细胞附着,毒性 5 1611 NSP1 59 非结构性 对于病毒成长非必须 6 1356 VP6 45 内壳体 结构性与物种特殊性的抗原 7 1104 NSP3 37 非结构性 强化病毒信使核糖核酸的活性,并停止受感染细胞的蛋白质合成 8 1059 NSP2 35 非结构性 包含在核糖核酸包装中的核苷三磷酸酶(NTPase) 9 1062 VP7VP7 3834 表面 结构性与中和抗原 10 751 NSP4 20 非结构性 肠毒素 11 667 NSP5NSP6 22 非结构性 结合NSP2调节因子的单链核糖核酸与双链核糖核酸 该表的资料是基于感染类人猿的轮状病毒SA11病毒株所编写。 在不同的病毒株中,核糖核酸与蛋白质之间的编码预测会有所不同。 轮状病毒感染小肠绒毛(villi)的肠黏膜细胞,改变上皮组织的结构与功能。 轮状病毒的三重蛋白质外层使它们可以抵抗胃中的胃酸以及消化系统中的消化酶(digestive enzyme)。

病毒借由受体媒介的内吞作用进入细胞,并且形成一个称作核内体(endosome)的囊泡。轮状病毒第三层的蛋白质(即VP7与VP4刺突)会分解核内体的外膜,而创造一个钙浓度不同的外膜。这个改变导致了VP7蛋白质三聚体破裂为一个单一蛋白质的子单元,留下围绕在病毒双链核糖核酸外面的VP2与VP6蛋白质,形成双层构造的病毒颗粒(DLP)。

七条双链核糖核酸链依旧维持两层蛋白质层,并提供病毒核糖核酸依赖性的核糖核酸聚合酶(RNA replicase或RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)创造双链病毒基因体的信使核糖核酸转录复本的保护。借由把病毒核糖核酸保持于病毒核心,病毒核糖核酸躲避了先天宿主的免疫反应。这个免疫反应称为核糖核酸干扰,会因为双链核糖核酸链的表现而触发。

在感染的过程中,轮状病毒产生信使核糖核酸来生物合成蛋白质并且进行基因复制。大部分的轮状病毒蛋白质都堆积在病毒质中,病毒质也是核糖核酸复制的地方,以及双层构造病毒颗粒组装的地方。病毒质于病毒感染细胞约两个小时之内就会快速地在细胞核周围形成,而组成所谓的“病毒工厂”,这个病毒工厂是由两个病毒非结构性蛋白质(NSP5与NSP2)所制成。NSP5蛋白质如果因为核糖核酸干扰而被压抑功能,会明显地减弱轮状病毒复制功能。新生的双层构造病毒颗粒则会移动到内质网,它们将在此处获得它们第三层外层(由VP7与VP4蛋白质所构成)。最后,这些后代病毒就会经由细胞裂解(lysis)释放到细胞之外。

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评论

精彩评论
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